原發性痛經需要和繼發性痛經和婦科急腹癥相鑒別。
第一,子宮內膜癥和子宮腺肌病是繼發性痛經最常見的原因,子宮內膜異位癥和子宮腺肌病多見于已婚、年長、多次流產、引產和婦科手術后的婦女。痛經是因為子宮內膜病灶侵蝕性生長和出血刺激局部腹膜導致的。痛經特點是深部盆腔痛、排便痛、性交痛,月經前和月經期明顯加重,月經后逐漸緩解。婦科檢查于子宮直腸,子宮直腸陷凹和子宮的韌帶處可以捫及單個或多個的觸動性結節和包塊,月經期的這個結節稍微增大一些,組織活檢病理或腹腔鏡檢查能確診。
第二,慢性盆腔炎,盆腔慢性炎癥瘢痕黏連和充血引起的下腹墜脹疼痛和腰骶部酸痛與月經期和性交時加重。婦科檢查子宮增大、活動受限、雙側附件區增厚壓痛或者是語言性包塊而形成,血液檢查的項目當中可見有中性粒細胞升高、血沉的增快。