一旦發生異位骨化,可以服用非類固醇類消炎藥,如吲哚美辛、消炎痛、布洛芬等或者進行放射治療以及手術治療。目前臨床上使用最廣泛的預防異位骨化的非類固醇類、消炎藥物是吲哚美辛,治療周期為六周,單次劑量的放療主要作用機制是抑制快速增殖和分化的骨祖細胞,因此需要及早治療。
減少小關節局部壓力和多活動患肢,也可以預防異位骨化,原則上應避免早期對受累局部進行熱療、超聲波和按摩,緩慢柔和的運動可以預防攣縮,防止過度牽拉,避免造成損傷和組織內出血,也可使用物理療法減輕局部組織的水腫和炎癥反應,應采取漸進性的運動練習,一旦懷疑骨化性肌炎發生,應停止被動活動,主動活動應限制在無痛的范圍內,不當的治療會使骨化加重。