大多數的慢性前列腺炎屬于非細菌性前列腺炎,對此病的致病源尚沒有統一的意見,由其它微生物、沙眼、衣原體、支原體、滴蟲、真菌、病毒等所致,也可能與性生活無規律,勃起而不射精,性交中斷,或長途汽車,長時間坐位工作,盆腔及前列腺充血等有關,過量飲酒即辛辣食物可加重前列腺炎的癥狀。
臨床表現類似慢性細菌性前列腺炎,所不同的是沒有反復尿路感染發作,體檢與臨床表現不一定相符。直腸指檢前列腺稍飽滿,有輕度壓痛,前列腺液內白細胞大于十個每高倍視野,但多是細菌涂片及培養都找不到細菌。用特殊的檢測方法有時候可獲得關于衣原體、支原體的佐證,臨床上具有慢性前列腺炎的癥狀,尤其是盆腔和陰部疼痛明顯,而前列腺液檢查正常,培養無細菌生長稱為前列腺痛。