主要包括病因治療、對癥治療和各種非藥物治療,要指出的是運動神經元病是一組異質性疾病,致病因素多樣,并且互相影響,所以它的治療必須是多種方法的聯合應用,期望用單個藥物和單種治療完全阻斷疾病的進展是不現實的。
當前病因治療的發展方向主要包括抗興奮性氨基酸毒性,營養神經因子,抗氧化和自由基清除,新型鈣通道阻滯劑,抗細胞凋亡,基因治療以及神經干細胞移植。利魯唑具有抑制谷氨酸釋放的作用,能夠延緩病程,延長延髓麻痹患者的生存期。也有使用潑尼松,環磷酰胺等治療本病,但必須定期復查血象和肝功能。對癥治療包括對吞咽,呼吸,痙攣,疼痛,營養障礙等并發癥和伴隨癥狀的治療,吞咽困難者應給予鼻飼飲食,有呼吸衰竭者可行氣管切開并機械通氣。