腮源性囊腫和腮瘺在術前應該治療口腔部感染,如果有齲齒或者扁桃體炎應進行相應的治療。另外腮源性囊腫和瘺有炎癥時要使用抗生素治療,在炎癥完全消退后再手術。要準備亞甲藍,如果術中瘺管走向不清時,可注射亞甲蘭幫助判斷。手術的原則切除囊腫及瘺管是唯一有效的根治方法。
手術應在一歲以后進行擇期手術,有感染者應先用抗生素控制感染。待炎癥完全消退后兩到三個月,盡早行根治手術。有氣道壓迫癥狀者,應先行囊腫穿刺或者切開減壓,再擇期根治手術。術后的并發癥可能包括神經血管損傷。再就是復發,預防復發的關鍵是正確處理囊腫的內瘺口,應盡量靠近咽側壁縫扎,切斷內瘺口,然后縫扎,使殘端內壁朝向咽腔,以減少復發。