感染包括細菌和病毒感染,是安卡相關性小血管炎患者最重要的合并癥和致死原因,也是復發的誘因,韋格納肉芽腫病患者鼻部攜帶金黃色葡萄球菌是復發的重要原因。應用復方磺胺甲惡唑清楚金黃色葡萄球菌,可顯著減少韋格納肉芽腫的復發,鼻部局部應用莫匹羅星也可以較好地清除金黃色葡萄球菌,還可以用于腎受損和無法應用復方磺胺甲惡唑的韋格納肉芽腫患者。
在應用激素與免疫抑制劑治療的過程中,可以應用磺胺類藥物預防卡氏肺囊蟲的感染。推薦方案為甲惡唑800mg和甲氧芐啶160mg,每周三次。系統性血管炎腎損害復發的治療尚缺乏循證醫學證據,在病情出現小的波動時,可以適當增加糖皮質激素和免疫抑制劑的劑量,而病情出現大的反復時,則需要重新開始誘導緩解治療。