臨床上出現血尿、蛋白尿、腎功能不全、高血壓尤其是低補體血癥時應高度考慮膜增生性腎小球腎炎。大多數膜增生性腎小球腎炎腎活體組織檢查標本,只有經過光鏡免疫熒光和電子顯微鏡檢查后才可以作出診斷。
有膜增生性腎小球腎炎組織病理學表現者,也可以見以系統性疾病,包括自身免疫性疾病比如系統性紅斑狼瘡性腎炎、混合型冷球蛋白血癥、干燥綜合癥、結節病以及典型肝炎、內臟膿腫感染性心內膜炎、分流性腎病、類風濕關節炎等。
還有感染性疾病比如乙型及丙型肝炎,再就是腫瘤包括淋巴瘤、白血病、腎胚細胞瘤、輕鏈病、三日瘧、血吸蟲感染、支原體感染,還有其他的比如連狀細胞病等。因此病理學上符合膜增生性腎小球腎炎,還應進行抗雙鏈DNA、冷球蛋白、血與尿蛋白電泳、乙肝病毒丙肝病毒血清標志物檢測。老年患者篩查惡性腫瘤檢測以確定是原發性還是繼發性的膜增生性腎小球腎炎。