第一、惡性腫瘤。惡性腫瘤的發生與環磷酰胺的總劑量有相關性,三十克以上發生腫瘤的機會明顯增加,多數為泌尿系、骨髓、皮膚的惡性腫瘤。
第二、出血性膀胱炎。由于環磷酰胺多數是通過尿路系統排泄,出血性膀胱炎一般在口服環磷酰胺以后產生,而且多數在服藥后未大量飲水,有人證實出血性膀胱炎發生后出現膀胱腫瘤的機率明顯上升,因此稱其為癌前損害。
第三、生殖毒性。應用環磷酰胺以后女子,尤其是中年以后婦女能導致卵巢功能衰竭,表現為閉經,不育,而且在妊娠婦女應用還可出現畸胎,男性應用后會產生睪丸萎縮、性欲喪失、無精或精子無力癥。
第四、感染。由于環磷酰胺能導致機體免疫力下降,因此容易形成各種細菌、病毒感染。