尿頻、尿急、腰痛的病因很多,主要是膀胱和尿道疾病,包括感染性疾病,如普通細菌,結核桿菌,真菌,寄生蟲等引起的膀胱炎,尿道炎,前列腺炎,尿道旁腺炎,龜頭炎,陰道炎,尖銳濕疣等等。
非感染性炎癥如間質性膀胱炎,放射性膀胱炎,化學性膀胱炎,結石,如膀胱結石,尿道結石,輸尿管下段結石,膀胱尿道前列腺腫瘤,膀胱和尿道內異物等等。尿道狹窄尿道口過小,處女膜傘異常,包莖等等也可以引起尿頻、尿急、尿痛。
除膀胱和尿道疾病外,腎盂腎炎,腎積膿,腎結核等腎臟疾病。膀胱尿道鄰近器官子宮,卵巢,結腸等疾病,神經性膀胱等精神神經系統疾病和白塞病等全身性疾病都可以引起尿頻、尿急、尿痛。