第一,就是細菌性的肺炎,它包括需氧革蘭氏染色陽性的球菌,比如肺炎鏈球菌、金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌等,還有需氧的格蘭氏染色陰性菌,比如肺炎克雷白桿菌、流感嗜血桿菌、大腸桿菌、綠膿桿菌,厭氧菌常見的就是棒狀桿菌和梭形桿菌的二類。
第二,常見的就是病毒性的肺炎,比如腺病毒、呼吸道病毒、流感病毒、麻疹病毒、巨細胞病毒和單純皰疹性病毒。
第三,常見的就是肺炎支原體引起的肺炎。
第四,是真菌性肺炎,比如白色念珠菌、曲菌和放線菌。
第五,是其他病原菌所導致的肺炎,比如立克次體、衣原體、弓形蟲、原蟲、寄生蟲。
機體免疫力低下的患者,比如艾滋病的患者容易伴發肺部的卡氏肺孢子蟲,軍團菌、分枝桿菌、結核菌、弓形體這些的感染。