軍團菌肺炎的典型患者常為亞急性起病,全身乏困無力、肌肉疼痛、發熱等,部分患者有二到十日的潛伏期,此后起病急驟,寒戰、高熱、胸痛、咳嗽、痰中帶少量血絲或血痰,患者可伴有消化道癥狀,如腹痛、腹瀉與嘔吐、水樣便,一般膿血便,可有心動過緩或頭痛。
少數軍團菌肺炎可有下列不典型表現:
一、淺表淋巴結普遍腫大,肝脾增大。
二、皮疹、關節腫痛,球蛋白升高及類風濕因子陽性。
三、哮喘持續狀態。
四、焦慮不安或反應遲鈍或步態異常,口齒不清及精神錯亂等神經精神癥狀。
病情嚴重者可發生呼吸衰竭,個別患者同時患有大腸桿菌、綠膿桿菌、念珠菌等混合感染,增加了治療的難度。