系統性紅斑狼瘡目前發病原因,還是不清楚的。對發病機制的研究,雖然有了很大的進展,但明確的具體的一些發病機制,還是不是很清楚。但現在研究發現,系統性紅斑狼瘡的發病與性激素、與環境、與微生物的感染,具有一定的原因。因為在系統性紅斑狼瘡患者中,育齡期的女性占有絕大多數,現在目前就認為雌激素可以促進,系統性紅斑狼瘡的發病。
除此之外,還有很多系統性紅斑狼瘡的患者,往往是在接受了紫外線的照射之后,病情開始出現活動,開始出現發病。因此在環境中,紫外線這些的照射對病情也是有一個促進的作用。還有一些患者在發病前,往往合并有一些病原體的感染,尤其是一些病毒的感染,像巨細胞的病毒,EB細胞的病毒。因此系統性紅斑狼瘡它的發病,是一個多因素導致的,涉及到環境因素、內分泌因素以及性激素因素等多個方面。