第一,“糞口”傳播:因為胃粘膜上皮更新脫落快,寄居其上的幽門螺桿菌必然隨之脫落,通過胃腸道從糞便排出,污染食物和水源傳播感染。已從胃液中分離培養出幽門螺桿菌,從腹瀉和胃酸缺乏的病人糞便中培養幽門螺桿菌。從自然環境中分離培養幽門螺桿菌亦是糞—口傳播的證據,有報告從南美國家溝渠水中分離幽門螺桿菌成功。
第二,“口口”和“胃口”傳播:根據隨胃上皮細胞脫落的幽門螺桿菌可存活在胃液中,通過胃—食道反流可進入口腔,滯留在牙菌斑中,通過唾液傳播感染。已有報告從唾液、反流嘔吐物、牙菌斑中檢測發現幽門螺桿菌。西非一組報告母親通過咀嚼食物后喂養的幼兒,與非咀嚼喂養的對照比較,幽門螺桿菌感染的危險系數為2.9倍。