尿常規檢查顯示白細胞計數增多或膿尿,伴有紅細胞增多,少數肉眼血尿,尿三杯試驗,可以在第一杯中發現大量膿細胞,紅細胞存在,第二杯,第三杯基本正常,初期尿細胞培養細菌數明顯高于中期尿,尿道或陰道分泌物涂片檢查,淋菌性尿道炎可見于細胞內或細胞外淋病,非特異性尿道炎可以用分泌物或前尿道拭子培養看到大量細菌生長,分泌物涂片和培養物都沒有發現細菌,即有支原體感染的可能性,衣原體感染,特殊方法可以培養或PCR。
慢性尿道炎需要尿道鏡膀胱鏡檢查以確定疾病的原因。有時,金屬尿道探針可用于測試尿道中是否存在狹窄。必要時,應進行尿道造影。