丙型肝炎病毒存在著許多基因型,在世界不同地區至少存在六種基因型,五十多種亞型。有研究顯示丙型肝炎病毒基因型與其致病性肝細胞癌的發生有一定關系,同時也有助于臨床醫生判斷治療的難易程度及制定抗病毒的治療的個體方案,因此具有重要的臨床意義。
一般認為,丙型肝炎病毒基因Ⅱ型和Ⅲ型對干擾素的治療反應優于丙型肝炎病毒基因型為Ⅰ型的病人,因此,針對Ⅱ型和Ⅲ型丙型肝炎病毒患者,選用干擾素治療效果會更好一些。
肝硬化及肝癌患者丙型肝炎病毒Ⅰb型明顯高于慢性肝炎,另外,慢性肝炎的丙型肝炎病毒Ⅰb型的患者發現率高于無癥狀性獻血員及谷丙轉氨酶正常的人群,但未發現丙型肝炎基因型與肝病嚴重程度、死亡率和肝癌發生率之間的關系。丙型肝炎病毒Ⅰb丙型肝炎復發,其肝病較其它基因型為重,每種基因型均可分布在各種各期肝病當中,但丙型肝炎病毒的基因型不能作為評價肝病嚴重程度的一個指標。