并不存在肛瘺怎么治療最好這種說法。一般來說，肛瘺患者可以通過加強生活管理、溫水坐浴、口服藥物、外用藥物、手術等方式治療，大概需要住3~7天院。一旦患病，建議及時就醫。
1、加強生活管理：
肛瘺通常是因肛管或直腸周圍膿腫所引起，表現為肛周自發性流膿和腫痛。出現此種情況后，應及時加強生活管理，飲食方面多吃一些含纖維素豐富的食物，比如蘋果、香蕉、白菜等，能夠促使糞便軟化，減少糞便對肛門部位刺激，控制病情發展。同時還需要養成定時排便的習慣，避免刻意的抑制便意。
2、溫水坐浴：
患病后應堅持每天使用溫水坐浴，可以準備一盆38℃左右的溫水，每天坐浴1~2次，每次坐浴15分鐘左右，可以加快局部的血液循環速度，對緩解腫脹、疼痛等癥狀有幫助。
3、口服藥物：
出現紅腫、疼痛、流膿等癥狀時，可以遵醫囑應用鹽酸左氧氟沙星片、頭孢克肟膠囊、阿莫西林膠囊等抗生素藥物進行治療，有助于促進局部炎癥消退。應用此類藥物時，可以遵醫囑使用溫開水送服。
4、外用藥物：
也可以在醫生指導下應用紅霉素軟膏、夫西地酸乳膏、氧化鋅軟膏等藥物進行治療，可以促使局部炎癥消退，同時還可以保護肛瘺周圍的皮膚，幫助患者減輕不適癥狀。患者在應用藥物之前，需要使用溫水對局部進行徹底沖洗，然后利用干凈的毛巾將局部殘留水分擦拭干凈，遵醫囑取合適的藥物劑量，對局部進行均勻涂抹，有助于藥效發揮。
5、手術：
如果患者病情比較嚴重，也可以在醫生操作下通過肛瘺切除術、掛線療法、肛瘺切開術等手術方式進行治療。患者在術后需要注意多休息，不可以過度勞累或者熬夜，遵醫囑對創面進行定期消毒，有助于恢復。
如果患者病情較輕，恢復速度比較快，大概需要住院3天。如果患者病情比較重，恢復速度比較慢，一般需要住院7天。這只是一個大概的參考范圍，具體應結合個人實際情況，遵醫囑選擇合適的住院時間。
