在臨床研究實驗中,成人的治療劑量的磷酸奧司他韋膠囊主要的副作用有惡心,嘔吐,腹瀉等消化道癥狀,常在第一次服藥后發生,絕大多數的情況下不會導致患者停藥,之后可逐漸緩解。還有部分患者可能會出現有支氣管炎,失眠,頭暈等癥狀,有少數的患者還會出現有咳嗽,眩暈,乏力的不良反應,一般停藥后癥狀會消失。
在治療的過程中,有極少部分的患者可能會出現有過敏反應,多見于皮疹,皮炎,大皰疹等,有極少數的患者可能會出現肝炎,甚至轉氨酶升高,還有個例的報道出現過有胰腺炎,血管性水腫,喉部水腫,支氣管痙攣,面部水腫,嗜酸性粒細胞升高,白細胞下降或血尿。若出現這些類似情況,一定要及時停藥。