結核性骨髓炎的治療一般情況下都是需要全身抗結核治療以及支持治療。如果有死骨形成,病情允許的話應該做手術,術后需要繼續抗結核并應用抗生素。一般情況下單純的顱骨結核可以選擇鏈霉素,異煙肼以及對氨基水楊酸三聯或者異煙肼,異煙肼醇,利福平三聯,或者單獨口服利福平治療,療程六個月以上并進行手術治療。
伴有身體其他部位結核的藥物選擇應該多樣化,根據情況選擇,全身狀況比較差的,應該進行輸血,加強營養,可以給予血清白蛋白輸注。另外對于結核性骨髓炎還可以適當的采用中醫治療方法,比如針對傳統骨髓炎反復發作和過度節食的情況要重視,重建患者的部位功能,另外要應用一些先進的治療手段,比如生物超氧多維于骨術。