尿細菌學檢查是診斷尿路感染的關鍵手段,如果發現有真性細菌尿,雖然沒有癥狀也可以診斷為尿路感染。尿細菌學檢查分為尿細菌定性培養和定量培養,尿標本可取中段尿、導尿和膀胱穿刺尿,尿定向培養需除外尿道及尿道周圍寄生的細菌污染,結果常常不是很可靠。
而對于尿定量培養,人們普遍認為清潔中段尿細菌定量培養的菌落計數要大于每毫升十的五次方,則為有意義的細菌尿。對于無癥狀細菌尿的患者,如果重復兩次或更多次清潔中段尿培養,菌落計數均大于每毫升十的五次方,而且為同一個菌種,要診斷為尿路感染,而并非是污染。另外尿涂片鏡檢細菌及尿化學檢查,因為設備簡單,操作方便,適用于基層醫療或者大規模篩選實驗。