有個別精神藥物是有致畸性的,大多數精神藥物被列為c類,也就是風險不能排除,這類藥缺乏人類研究數據,但是動物的試驗呈現一個陰性的或者是少數的這樣一個情況,這種潛在的風險容易被忽略。
碳酸鋰一直認為和心臟的先天畸形有關系,但是也有些研究并沒有做出這樣的數據。苯二氮?類過去認為和唇腭裂伴發,后來的研究孩子的唇腭裂的發生風險也沒有顯著的增加。用于心境穩定劑的藥物像丙戊酸鹽,卡馬西平與增加先天畸形的風險相伴發,所以這類藥物禁用于妊娠。
同時像三環類抗抑郁藥應用與妊娠期是相對比較安全的,像常用的阿米替林、丙咪嗪、氯丙咪嗪,但是在用藥期間做好需要濃度的監測。選擇性五羥色胺再攝取抑制劑一般相對也是比較安全的,優先要選擇的是舍曲林,西太普蘭。
典型的抗精神病藥物像氯丙嗪,氟哌啶醇等等,也是相對比較安全的。氯氮平可以引起粒細胞缺乏,但是對于懷孕以后暴露在氯氮平這種環境下的嬰兒,并沒有發生實質性的提高。所以,在應用藥物的時候先選用這種藥物相對比較安全的,像氯氮平只有在難治性精神分裂癥患者當中才會選用。