首先要進行合理喂養,提倡母乳喂養,及時添加輔助食品,每次添加時先一種,逐步增加,適時斷奶,人工喂養者應該根據具體情況選擇合適的代乳品。對于生理性腹瀉的嬰兒應避免不適當的藥物治療,不要由于嬰兒便次多而懷疑其消化能力,而不按時添加輔食,要注意養成良好的衛生習慣,注意乳品的保存和奶具、食具、便器、玩具和設備的定期消毒。
對于感染性腹瀉患兒,尤其是大腸桿菌,屬傷寒沙門菌、輪狀病毒腸炎的傳染性強,集體機構若流行,應積極治療患者做好消毒隔離工作。另外要避免長期濫用廣譜抗生素,對于即使無消化道癥狀的嬰幼兒,在因敗血癥、肺炎等腸道外感染,必須使用抗生素,特別是廣譜抗生素時,應加用微生態制劑,防止由于難治性腸道菌群失調所致的腹瀉。
對于輪狀病毒感染性腹瀉,目前輪狀病毒疫苗接種是預防輪狀病毒腸炎的理想方法,口服疫苗已見諸報道,保護率在80%以上,但持久性尚待研究。