薄基底膜腎病的臨床表現有:可以發生于任何年齡,男女比例約為一比二至三,大部分患者表現為血尿,多數患者尤其是成人表現為持續性鏡下血尿。在上呼吸道感染期間或感染后偶爾在劇烈運動以后,部分患者可以出現肉眼血尿,約三分之一的患者有紅細胞管型,絕大多數患者尿紅細胞位相行胃鏡檢查為大小不一,多種形態的腎小球圓形的紅細胞。
兒童往往是以無癥狀,單純性血尿為多見,成人患者中45%,65%,合并有輕度蛋白尿。約三分之一的患者有腰部頓痛或者酸痛感。最近也有作者報道,極少數薄基底膜腎炎的成人患者以大量蛋白量為重要臨床表現。多數研究表明患者血壓通常是正常,但也有報道部分成人患者可有輕度高血壓,薄基底膜腎病的患者預后良好,腎功能可長期維持在正常范圍,有的患者已經隨訪超過三十年,腎功能仍然正常。