急性再生障礙性貧血的并發癥主要是見于出血,血小板減少所導致出血常常是患者就診的主要原因,同時也是主要并發癥。表現為皮膚瘀點瘀斑,或者牙齦出血以及鼻出血;在年輕女性當中可能會有月經量的過多,不規則的陰道出血;有可能會出現內臟出血比如消化道、泌尿道、呼吸道出血;當然也有可能會引起眼底出血以及顱內出血。患者出現嚴重的鼻出血等。
顱內出血,往往患者會有頭痛、惡心、嘔吐,視物不清,有可能會危及患者生命。再就是出現貧血并發癥,紅細胞減少會導致貧血,患者出現乏力活動后心悸,氣短、頭暈、耳鳴患者血紅蛋白的濃度下降有可能比較快,癥狀出現的也比較顯著。另外有可能會導致貧血性心臟病。
還有就是出現感染并發癥,白細胞減少所導致的感染是再生障礙性貧血比較常見的并發癥。輕的可能會有持續發熱,體重下降,食欲不振。重的可能會出現嚴重系統性感染,此時因血細胞低,使炎癥不能局限,嚴重的可能會發生敗血癥。