川崎病手腳疼痛屬于關節并發癥之一,川崎病還會引起關節炎或關節痛,發病兩星期內出現關節痛或者關節炎,有文獻報告甚至癥狀可以持續打到四個月之久,常發生于急性期和亞急性期大小關節均可受累,約見于20%的病例隨病情好轉而痊愈,甚至會引起神經系統的改變。
由于血管炎在急性期本病可引起無菌性腦脊髓膜炎、面神經麻痹、聽力喪失,急性腦病和高熱驚厥等等,臨床比較多見,恢復比較快,預后良好,過后部分患兒顱內壓高,表現為前顱隆起,少數患兒頸項強直,可有嗜睡、雙眼凝視、昏迷等意識障礙,臨床癥狀多在數日內消失,恢復期則引起的肢體癱瘓,遺留后遺癥但較為少見。